 שנה"ל תשע"ו | |||||||||||||||||||||||||
 |
 |
||||||||||||||||||||||||
|
הדמיית והנדסת ביטוי גנים
Modeling and Engineering Gene Expression |
0553-5517-01 | ||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| הנדסה | תואר שני - הנדסה ביו-רפואית | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
ש"ס: 3.0
סילבוס מקוצר
משקל: 3 נ.ז.
דרישות קדם: 0555.1140 הסתברות
0555.2240 סטטיסטיקה
ביולוגיה של התא (מומלץ אבל לא הכרחי);
ידע בסיסי בתכנות בעזרת MATLAB.
ביטוי גנים זהו התהליך שבו אינפורמציה שמקודדת בגנים משמשת לסינתזה של חלבונים. ביטוי גנים מתרחש כמעט כל הזמן בכל התאים. ולכן להבנה, מידול, והנדסה של התהליך השלכות הקשורות לכל הדיסציפלינות הביו-רפואיות (למשל רפואה, הנדסה ביו-רפואית, ביוטכנולוגיה, אבולוציה, חקלאות ועוד).
הקורס ידון בשיטות מחקר ואסטרטגיות להנדסת ביטוי גנים.
בפרט נדון בארבעה שלבים הדרושים בכדי להשיג מטרה זו:
1) הסקה סטטיסטית של תת-סדרות של התעתיק שקשורות לבקרת ביטוי גנים. 2) הדמיה ממוחשבת של ההיבטים הביו-פיזיקאליים של ביטוי גנים והדינאמיקה של התהליך. 3) הנדסת ביטוי גנים על סמך המודלים חישוביים ואלגוריתמים מתאימים. 4) מדידות של ביטוי גנים, מניפולציה של ביטוי גנים, וביולוגיה סינתטית.
Course description
Gene expression is the process by which the information encoded in genes is used for the synthesis of proteins. This process occurs in all cells at all times; thus, understating, modeling, and engineering this process have important ramifications to every biomedical discipline including medicine and human health, biomedical engineering, biotechnology, agriculture, and basic life sciences.
The course deals with various research approaches leading to rational engineering of gene expression. Specifically, we will discuss the four major steps necessary for achieving this goal: 1) Statistically inferring transcript motifs related to gene expression regulation; 2) Developing computational biophysical models of the transcripts’ gene expression regulation dynamics; 3) Engineering the expression levels of transcripts based on biophysical models and sequence design algorithms; 4) Experimentally measuring and manipulating aspects of gene expression.
הנדסה | תואר שני - הנדסה ביו-רפואית
0553-5517-01 הדמיית והנדסת ביטוי גנים
Modeling and Engineering Gene Expression
שנה"ל תשע"ו | סמ' ב' | פרופ טולר תמיר
666סילבוס מפורט/דף מידע
הרכב הציון: 30-50% תרגילי בית, 50-70% מבחן. חובה לעבור את המבחן בציון מעל 60.